विश्वविद्यालय द्वारा अनेक कॉलेजों, संस्थानों, केंद्रों तथा विद्यालयों का भी संचालन किया जाता है। इनमे विशेष रूप से वूमेंस कॉलेज, व्यावसायिक पाठ्यक्रम केंद्र, अंतर-अनुशासनिक जैवतकनीकी इकाई, ज़ाकिर हुसैन अभियांत्रिकी एवं तकनीकी कॉलेज, अजमल खान तिब्बिया कॉलेज, जवाहरलाल नेहरु मेडिकल कॉलेज, डॉ. ज़ियाउद्दीन अहमद डेंटल कॉलेज, इंस्टीट्यूट ऑफ ऑप्थल्मोलॉजी, सेंटर फॉर एडवांस्ड स्टडीज़ इन हिस्ट्री, सेंटर फॉर वूमेन स्टडीज़, सेंटर फॉर नेहरू स्टडीज़, यूनिवर्सिटी पॉलिटेक्निक, वूमेंस पॉलिटेक्निक, के.ए. निज़ामी क़ुरानिक अध्ययन केंद्र एवं दृष्टिबाधित छात्रों हेतु एक विद्यालय भी सम्मिलित है ।